Bioperl è un popolare progetto open source che fornisce una libreria completa di moduli per la gestione e la manipolazione dei dati relativi alle scienze della vita. Gli scienziati contribuiscono a moduli Bioperl che sono scritte nel linguaggio di programmazione Perl . Molti scienziati e ingegneri utilizzano MATLAB , un linguaggio di programmazione ad alto livello sviluppato dalla MathWorks per il calcolo tecnico . MATLAB è molto popolare sia il mondo accademico e l'industria , perché il suo linguaggio permette agli utenti di creare rapidamente il codice per analizzare i dati , sviluppare algoritmi e creare visualizzazioni . Invece di imparare il Perl , è possibile sfruttare le funzionalità di Bioperl semplicemente chiamando moduli Bioperl da MATLAB , così approfittando della vostra conoscenza esistente di MATLAB in aggiunta alla potenza dei moduli Bioperl . Istruzioni
1
Installare Bioperl sul sistema seguendo le istruzioni appropriate per il sistema operativo sul sito web Bioperl ( Bioperl.org ) .
2
Tipo " perl ( ' BioPerlModule ') "nella finestra di comando di MATLAB in cui " BioPerlModule " viene sostituito con il nome del modulo BioPerl che si desidera eseguire .
3
per eseguire un modulo BioPerl che richiede l'input argomenti , digitare " perl ( ' BioPerlModule ' , ' arg1 ' , ' arg2 ' , ... ) " , dove " BioPerlModule " viene sostituito con il nome del modulo BioPerl e "' arg1 arg2 ', ' ', ... " viene sostituito con i nomi delle variabili che si desidera utilizzare come argomenti dei moduli Bioperl .