PDB sta per Banca Dati delle Proteine. È un archivio di dati strutturali tridimensionali di grandi molecole di significato biologico, come proteine, DNA e RNA. Il PDB è un archivio gestito dalla Worldwide Protein Data Bank (wwPDB), un consorzio del Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), dall'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) e dalla Protein Data Bank Japan (PDBj). Il PDB contiene strutture determinate sperimentalmente di biomolecole, comprese coordinate atomiche, condizioni sperimentali e altri dati rilevanti. I dati nel PDB sono liberamente disponibili al pubblico e vengono utilizzati dagli scienziati per la ricerca, la formazione e la progettazione di farmaci.