MicroATX non aumenta il costo totale di un sistema in base al numero di slot di espansione sulla scheda madre. Le schede madri MicroATX generalmente hanno meno slot di espansione rispetto alle schede madri ATX, il che può comportare un costo inferiore per la scheda madre stessa. Tuttavia, la differenza di costo è solitamente trascurabile e non influisce in modo significativo sul costo complessivo del sistema. Il costo totale di un sistema dipende da vari fattori, come i componenti scelti (ad esempio CPU, GPU, memoria, storage), dimensioni del case, alimentatore e funzionalità o accessori aggiuntivi.