Come estrarre Unaligned legge da un BAM

BAM file sono formati binari di lettori sequencer . Essi memorizzare i dati scientifici nucleotide in un formato compresso , mescolando entrambi allineati e non allineati letture insieme . Essi sono controllati con la funzione " bam2fastq " , un comando del computer che viene installato con molti programmi nucleotide - sequenziamento ( è anche possibile ottenere gratuitamente . ) Per estrarre il unaligned legge da un file di BAM , quindi , tutto ciò che serve è Windows riga di comando. Istruzioni
1

Tipo " bam2fastq " nella barra di ricerca del menu Start per assicurarsi di avere lo strumento ( non c'è bisogno di aprirlo. ) Se non lo fai , ottenerlo gratuitamente in Risorse .
2

tipo " cmd.exe " nella barra di ricerca del menu Start. Fare clic su " cmd.exe " quando appare sopra . Questo apre la riga di comando di Windows
3

Type ". Bam2fastq - FILELOCATION.bam non allineato " (senza virgolette ) nella finestra di comando
4

Sostituire. " filelocation " con la posizione del file di BAM . Utilizzare il formato di C : . . \\ Folder1 \\ Cartella2 \\ File.bam "
5

Hit " Invio " Questo farà apparire una finestra di testo con la legge non allineato da quel particolare BAM il file < . br>

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