Come convertire un PPB per un FASTA

L'estensione del file PDB è l'acronimo di "banca dati delle proteine " e contiene al suo interno il testo che descrive la struttura tridimensionale delle proteine molecolari . Esso è utilizzato per memorizzare le informazioni nella banca dati di proteine , che è un database sempre crescente che organizza tutte le proteine note . Il tipo di file FASTA è usato da software di analisi di DNA per produrre rappresentazioni bidimensionali delle proteine e valutare la loro somiglianza . PDB possono essere convertiti in file FASTA , in modo che queste rappresentazioni bidimensionali di proteine possono essere studiate . Le rappresentazioni bidimensionali sono molto più semplici da analizzare e confrontare rispetto alla versione a tre dimensioni , ed è per questo motivo che i ricercatori a volte preferiscono fare il loro lavoro in software FASTA . Cose che ti serviranno
computer con Windows XP , Vista o 7
Mostra più istruzioni
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Scarica la Proteina avanzata Sequenza convertitore collegato in Risorse . Questo è l'unico software disponibile che converte PDB per FASTA .
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Installare la Proteina avanzata Sequence Converter sul tuo computer.
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Aprire la Proteina avanzata programma Converter sequenza.
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Fare clic su " File " e poi " Apri file ".
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Selezionare il file PDB dalla finestra del browser che si apre.

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Fare clic su " Apri".
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Scegliere " Per FASTA Format" in " Export" voce in basso a destra del programma .
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Clicca su "Opzioni " e poi " Impostazioni ".
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Scegliere la lunghezza della stringa si preferisce il file FASTA per essere esportati in .
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Fare clic su "OK . "
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Fare clic sul pulsante" Esporta " . Il file PDB sarà ora convertito in un file FASTA con le lunghezze di stringa di proteine che avete indicato .